Кроме лечебной помощи на Центр СПИД возложена ответственность организация и проведения профилактической работы по ВИЧ - инфекции среди различных слоев населения.

Отдел профилактики, кроме этого, готовит различную просветительскую и информационную литературу: листовки, брошюры, плакаты, открытки, посвященную проблеме ВИЧ/СПИД. Этот отдел также проводит масштабные акции, которыми отмечают определенные даты, связанные с этой проблемой.

Благодаря использованию компьютерных технологий разработаны для школьников компьютерные игры, объясняющие механизмы заражения вирусом иммунодефицита человека, а также возможность профилактирования инфицирования.

Функционирует в Центре и отдел клинической эпидемиологии, осуществляющий постоянный мониторинг течения эпидемии ВИЧ - инфекции в городе, устанавливает главные движущие силы эпидемии, проводит анализ эффективности реализуемых мероприятий, и вносит предложения по их корректировке.

Отдел эпидемиологии также занимается эпидемиологическим расследованием очагов ВИЧ - инфекции в различных учреждениях.

В поликлиническом отделении Центра работает кабинет анонимного консультирования и обследования на ВИЧ - инфекцию для всех обращающихся. Здесь же можно обменять использованные шприцы на новые, получить презервативы и различные просветительские материалы.

Работа поликлиники построена таким образом, что обратившийся в Центр может получить различную медицинскую помощь, включая и бесплатную стоматологическую.

Очень важным звеном в поликлиническом отделении является педиатрическое. В связи с ростом в последние годы числа детей, рожденных от ВИЧ - позитивных матерей, педиатрический прием проводится ежедневно на Бумажной ул., дом 12. А открытие палаты "Мать и дитя", где в дневное время одновременно могут находиться и проходит углубленное обследование не только мать и ребенок, но отец ребенка, способствует своевременно выявить различную патологию, связанную с ВИЧ, начать необходимое лечение и следить за его эффективностью.

В Центре СПИД работает мобильная бригада медицинской помощи, которая оказывает медицинские услуги на дому больным, состоящим на учете в Центре.

Центр СПИД активно работает с общественными (неправительственными) организациями, деятельность которых направлена как на профилактику ВИЧ - инфекции среди контингента риска, так и на людей, живущих с ВИЧ/СПИД. Кроме этого любой пациент может получить квалифицированную юридическую помощь, связанную с его проблемами.